自20世纪80年代凯利·穆利斯发明第一代PCR技术以来,“变性、退火、延伸”这三个简单的步骤,历经三十多年的蓬勃发展,如今,PCR技术已成为分子生物学领域不可或缺的基础研究工具,广泛应用于基因扩增、基因检测、基因编辑等多个领域。本文将为您详细介绍一代PCR的常见类型及其应用,助力您的科学研究。
常规PCR
常规PCR一般是由Taq DNA聚合酶介导的PCR反应,操作较为简便,产物带有A尾。通过琼脂糖凝胶电泳对终产物进行定性和半定量分析。兼容样本范围广,但保真性低,主要应用于常规重组质粒验证和基因型鉴定等方面。
常规PCR产品
产品名称:2×PCR Master Mix (With Dye) 2×常规PCR预混液(含染料)(N132002)
产品特点:
1)基础PCR,分子实验必备。
2)适用于菌液PCR和基因鉴定。
3)扩增出来的产物均是3端带A的,同时均具有5’-3’外切酶活性。
高保真PCR
高保真PCR一般是由保真性较高的DNA聚合酶介导的PCR反应。第一代高保真DNA聚合酶是从栖热原始菌Pyrococcus furiosus中获得的具有校正功能的pfu酶,与常规Taq酶相比多了一种3’-5’的核酸外切酶活性(Proofreading活性),保真性大大提高且扩增的产物通常为平末端。目前主要有2类产品:一类是混合型的高保真酶,将带有Proofreading活性的酶与普通Taq酶混合用于提高扩增效率;另一类是单一型的高保真酶,保真性更高。
高保真PCR产品
产品名称:2× High-Fidelity PCR Master Mix (With Dye) 2×一代高保真PCR预混液(含染料)(N132014)
产品特点:
1)高保真PCR,83倍Taq。
2)超高特异性。
3)高性价比。
图1. 对不同GC模板均能有效扩增
热启动PCR
热启动PCR,也称Hotstart PCR。指通过一定条件将DNA聚合酶与其他PCR反应物隔绝,使其低温条件下无活性,高温加热后释放酶活,进而避免出现非特异性产物的PCR反应。热启动PCR的关键是热启动型的DNA聚合酶,一般通过抗体、配体或化学修饰等来封闭酶活性中心,不同的热启动修饰方法原理上有所区别,各有优劣势(见下表)。通常应用于复杂模板、低拷贝基因扩增,也是IVD试剂的核心原料。
化学修饰 |
配体修饰 |
抗体修饰 |
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原理 |
低温下,化学小分子和DNA聚合酶活性中心结合,酶无活性;温度升高至变性温度,两者脱离,酶活性中心暴露,此时,聚合酶发生聚合反应。 |
核酸适配体通过非共价键作用与聚合酶结合,进而抑制聚合酶在非许可温度下的聚合反应。 |
高温变性前,抗Taq抗体与Taq酶结合,抑制聚合酶活性。温度升高至变性温度,抗Taq抗体变性失活,聚合酶发生聚合反应。 |
优点 |
酶活性维持更加稳定且无任何外源DNA污染,性价比较高。 |
酶激活时间短,保证酶活。 |
酶激活时间短,保证酶活,亲和力强,灵敏度高。 |
缺点 |
酶激活时间较长,可能会影响酶的活性,导致 PCR 产物的产量降低。 |
核酸配体是一种可逆抑制剂,不如化学修饰法稳定,特异性不够强。 |
抗体修饰是一种动态平衡,不如化学修饰法稳定,价格更贵。 |
热启动PCR产品
产品名称:2×HotStart Fast PCR Master Mix (With Dye) 2×热启动快速PCR预混液(含染料)(N132001)
产品特点:
1)快至1sec/kb。
2)兼容70%GC、长10kb片段。
3)十余物种数百个片段验证高特异、高检出,菌P亦适用。
图2. 对不同物种检测结果
直扩PCR
直扩PCR技术,是以未经基因组纯化的微量原始样本或其裂解产物作为模板进行PCR反应。广泛适用于血液样本、植物和动物等组织,与常规PCR相比,样本用量少、操作简单、实验成本低、可高通量化操作。可应用于基因分型、转基因鉴定等实验。
Arcegen直扩PCR系列产品运用独特的裂解体系,快速裂解样品,裂解液可直接作为模板,搭配试剂盒中的具有超强抑制物耐受性的Taq DNA聚合酶进行基因的高效扩增。
图3.组织直扩系列流程图
小鼠直扩PCR产品
产品名称:Mouse Tissue Direct PCR Kit (With Dye) 小鼠组织直接PCR试剂盒(N132021)
产品特点:
1)样本需要量少:5mg鼠组织或1-5mm鼠尾。
2)模板制备更方便:无需研磨,无需精提纯化gDNA。
3)优化的PCR体系:具有更高的特异性、更强的 PCR 反应抑制物耐受性。
图4.适合不同类型的小鼠粗提组织
多重PCR
多重PCR,也称复合PCR。反应原理、反应过程与常规PCR无异,需要在同一个PCR反应体系中,使用多对引物对多个基因同时进行扩增。理论上只要PCR扩增的条件合适,引物对的数量可以不限,但实际由于各种条件的限制,实际能够扩增的产物有限。多重PCR反应体系的组成和PCR循环的条件需经过优化以确保同时扩增多个片段。具有高效性、系统性、经济简便性,难点是反应体系各组分的平衡。主要用于多种病原微生物的同时检测或鉴定某些病原微生物、某些遗传病及癌基因的分型鉴定。
图5.多重PCR原理图
多重PCR产品
产品名称:Multiplex qPCR Probe Master Mix 通用多重qPCR探针法预混液(N132041)
产品特点:
1)兼容5重,灵敏度高达500copies/mL。
2)可耐受0.5%体积全血。
3)支持快速程序,1h内完成结果检测。
4)24个月实时稳定检测合格,反复冻融性能稳定。
图6.相对于竞品,更高的检出率
巢式PCR
巢式PCR是指利用两对引物进行两轮PCR扩增的反应。首先使用目的片段外围的引物对模板进行扩增,然后使用内部的巢式引物同时将第一轮PCR扩增产物作为第二轮扩增的模板。第二次PCR扩增得到的目的片断短于第一次扩增。翌圣GMyc-PCR 支原体检测试剂盒基于支原体16S-23S rRNA序列保守区域利用巢式PCR法原理可精确检测到常见的支原体污染。主要应用于病毒检测、测序分析、低表达基因检测等。
降落PCR
降落PCR,又称Touch-down PCR。通过设置PCR程序中的退火温度,一般开始时高于预设的Tm值,随着反应的进行,退火温度逐渐降低到Tm值,并最终低于该温度进行PCR反应。通过反应程序中退火温度的设置,极大程度上降低了引物与模板的非特异性结合。主要用于PCR反应程序的优化,提高产物特异性。
常见的PCR类型介绍就到这里了。当然,除了上述介绍的PCR形式,还有锚定PCR、原位PCR等不同的PCR类型,如感兴趣可自行查阅。
产品订购
产品应用 |
产品名称 |
产品货号 |
规格 |
目录价 |
常规PCR |
N132002E |
1 mL |
40.00 |
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N132002S |
5×1 mL |
150.00 |
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N132002M |
50×1 mL |
1200.00 |
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N132002L |
100×1mL |
2000.00 |
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高保真PCR |
N132014S |
1 mL |
350.00 |
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N132014M |
5×1 mL |
1350.00 |
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N132014L |
100×1 mL |
19000.00 |
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热启动PCR |
N132001E |
1 mL |
60.00 |
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N132001S |
5×1 mL |
250.00 |
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N132001M |
50×1 mL |
2000.00 |
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N132001L |
100×1mL |
3500.00 |
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直扩PCR |
N132021E |
50 T |
300.00 |
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N132021S |
200 T |
900.00 |
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多重PCR |
N132141E |
1 mL |
1200.00 |
|
N132141S |
5×1 mL |
5200.00 |
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N132141M |
20 mL |
19200.00 |