转录组测序，是指通过高通量测序研究特定组织或细胞在某个时期转录出来的总mRNA。可发现不同生理或者病理状态下的细胞、组织或个体内差异表达的基因，可预测SNP位点及可变剪接，发现新的mRNA isoforms，ncRNA等。
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该芯片包含了干扰素和白细胞介素，以及骨形成蛋白（BMP）和TGF-ß家庭的成员，也包含了血小板来源和血管内皮生长因子基因，肿瘤坏死因子以及其他细胞因子相关基因也包含在内。通过实时定量PCR的方法，研究者即能够利用该芯片简单可靠地同时检测细胞因子相关基因的表
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microRNA是一类小分子非编码RNA，越来越多的研究证实microRNA作为癌症及其他多种疾病的生物标志物，对疾病研究有重要意义。
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炎性基因表达PCR芯片包括编码炎性体组件的基因、炎性体功能发挥的下游信号和抑制基因、其他NLR家庭成员，以及可能形成更多的炎性体和其下游信号的基因。
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乳腺癌基因表达PCR芯片可用于研究与乳腺癌失调、乳腺癌细胞信号转导，及其他生物过程失调有关的84个关键基因的表达。
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胰岛素抵抗基因表达PCR芯片包括胰岛素和脂联素信号通路相关的脂肪基因、通常在NIDDM中失调的基因、先天免疫和炎症过程有关的基因，以及碳水化合物和脂质代谢过程中重要的酶和转运蛋白相关基因。
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目标区域捕获是针对感兴趣的特定基因组区域，设计探针富集特定基因组区域，并通过高通量测序技术检测目标区域特定的遗传性突变或者体细胞突变。目标区域测序可用于寻找复杂疾病如癌症、糖尿病、肥胖症等的致病基因和易感基因，为攻克人类的这些疑难杂症提供一种全新的方
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在癌组织中，与野生型DNA序列的高含量相比，体细胞突变往往只是微乎其微的量。在这样一个大量野生型等位基因存在的背景下检测这些稀有突变是相当具有挑战性的。
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Polycomb & Trithorax复合物靶基因基因表达PCR芯片可以同时检测被Polycomb &Trithorax复合物调控的84个关键基因的表达。
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