在蛋白质组学和生物制药研究中，准确解析蛋白质的氨基酸序列（一级结构）是揭示其功能与生物学意义的基础。然而，传统蛋白质测序依赖于数据库比对，难以应对未知蛋白、新型突变体或未被注释的物种。随着科学研究不断深入，这一局限亟需突破。蛋白从头测序（De Novo Sequencing），作为一种无需数据库支持、直接从质谱数据推测蛋白序列的技术，正为蛋白质结构解析开辟全新路径。

一、什么是蛋白从头测序？

蛋白从头测序（De Novo Sequencing）是一种基于质谱（MS/MS）数据，无需参考数据库，通过解析肽段的碎裂离子图谱，直接推测蛋白质氨基酸序列的方法。不同于传统蛋白鉴定依赖“数据库已知序列”的方式，从头测序能独立识别新发现的蛋白、突变体、复杂修饰蛋白，在非模式生物、新型抗体等未知体系中展现出强大优势。

二、蛋白从头测序为何重要？

1、破解数据库未收录的未知蛋白

在自然界、疾病样本或新药开发中，存在大量数据库未记录的蛋白质。从头测序使得这些“未知蛋白”无需任何序列信息先验即可解析，尤其适用于非模式生物、天然产物、极端环境微生物等领域。

2、解析抗体与重组蛋白真实序列

对于抗体药物和重组蛋白，从头测序能够直接确定其实际表达产物的氨基酸序列，验证是否存在突变、修饰或表达偏差，是生物药质量控制与一致性验证的工具。

3、发现突变和新型翻译后修饰（PTMs）

从头测序可识别未知的突变位点，以及罕见或组合复杂的修饰（如糖基化、磷酸化），无需事先假定修饰类型，有助于探索疾病相关突变、药物作用靶点等关键信息。

三、蛋白从头测序与传统数据库测序有何不同？

四、蛋白从头测序的应用场景

蛋白从头测序的崛起，标志着蛋白质组学从“已知验证”迈入“未知探索”的新阶段。其突破传统分析框架的能力，不仅推动了基础研究的边界拓展，更在疾病诊断、药物开发、合成生物学等领域展现出变革性潜力。未来，结合高分辨率质谱技术、人工智能算法以及更高效的样品制备方法，蛋白从头测序将进一步提高准确性和通量。百泰派克生物科技提供准确且快速的蛋白从头测序服务，获国家CNAS实验室认可，助力研究人员全面理解相关内容。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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